📁 医学大数据挖掘系列课程
  📁 4 基因表达甲基化识别肿瘤预后因子
  📁 6 多组转录组筛选癌症预后标志物
  📁 1 识别单基因家族在癌症中预后作用
  📁 5 癌症亚型间特异基因表达突变模式
  📁 3 识别自噬相关的预后标志物
  📁 2 识别DNA甲基化生物标志物
  📁 7 识别癌症lncRNA预后标志物
    📁 多组转录组筛选癌症预后标志物
    📄 课时02.Part2&数据获取及预处理.avi
    📄 课时01.Part1&分析流程概述.avi
    📄 课时07.数据和代码下载见pc端左下角参考资料.swf
    📄 课时05.Part5&生存相关基因的识别和验证.avi
    📄 课时03.Part3&批次效应校正及效果评估.avi
    📄 课时04.Part4&差异表达分析.avi
    📄 课时06.联合多组转录组数据筛选癌症预后标志物讲解.avi
    📄 课时03.基因家族预后作用的识别.avi
    📄 课时01.分析流程概述.avi
    📄 课时02.在线工具简介.avi
    📄 课时04.识别基因家族在癌症中的预后作用--资料.swf
    📄 资料.zip
    📁 生信套路分析-识别癌症亚型间特异性基因表达和突变模式
    📄 课时09.识别癌症亚型间特异性基因表达和突变模式（程序补充）.avi
    📄 课时01.Part1&分析流程概述.avi
    📄 课时10.见本课程pc端左下角参考资料.swf
    📄 课时02.Part2&数据获取及预处理.avi
    📄 课时08.Part8&GEO数据集验证.avi
    📄 课时06.Part6&亚型特异性体细胞突变.avi
    📄 课时05.Part5&亚型的生物学过程.avi
    📄 课时07.Part7&亚型的生物标志物.avi
    📄 课时04.Part4&亚型特异性基因获取.avi
    📄 课时03.Part3&识别分子亚型.avi
    📁 基于基因表达和甲基化分析识别肿瘤预后因子联合分析
    📄 课时03.Part3&差异表达差异甲基化基因的获取.avi
    📄 课时02.Part2&数据获取及预处理.avi
    📄 课时06.基于基因表达和甲基化分析识别肿瘤预后因子（代码补充）.avi
    📄 课时05.Part5&DLL3基因表达水平验证.avi
    📄 课时01.Part1&分析流程概述.avi
    📄 课时07.代码和资料见pc端左下角参考资料.swf
    📄 课时04.Part4&预后相关差异基因的识别.avi
      📁 数据预处理
      📁 最终程序
      📄 2ENSG.zip
      📄 RMA.zip
      📄 数据.zip
    📁 识别自噬相关的预后标志物
    📄 课时11.左下角-参考资料.swf
    📄 课时04.Part4&自噬相关风险标记的识别.avi
    📄 课时02.Part2&数据获取及预处理.avi
    📄 课时05.Part5&自噬相关标记与临床信息的相关性.avi
    📄 课时09.Part9&风险标记与基因突变的相关性.avi
    📄 课时08.Part8&癌症预后风险预测.avi
    📄 课时01.Part1&分析流程概述.avi
    📄 课时10.识别自噬相关的预后标志物-程序讲解.avi
    📄 课时07.Part7&独立预后标志物的验证.avi
    📄 课时06.Part6&独立预后标志物的识别.avi
    📄 课时03.Part3&自噬基因表达模式的识别.avi
    📁 DNA甲基化标志物-代码和资料
    📄 课时07.左下角-参考资料.swf
    📄 课时05.生存相关基因和甲基化的识别.avi
    📄 课时01.分析流程概述.avi
    📄 课时06.识别DNA甲基化生物标志物（代码讲解）.avi
    📄 课时02.数据获取及预处理.avi
    📄 课时04.关键模块的识别.avi
    📄 课时03.差异基因和甲基化的获取.avi
    📁 lncRNA
    📄 课时04.Part4&预后相关lncRNA的识别.avi
    📄 课时03.Part3&差异表达lncRNA的获取.avi
    📄 课时07.见本课程PC端左下角参考资料.swf
    📄 课时06.基于lncRNA表达谱识别癌症潜在预后标志物(代码补充).avi
    📄 课时01.Part1&分析流程概述.avi
    📄 课时05.Part5&lncRNA验证及功能分析.avi
    📄 课时02.Part2&数据获取及预处理.avi
      📁 资料
      📁 资料
        📄 3.验证批次效应：主成分分析.R
        📄 3.验证批次效应：线性回归.R
        📄 2.探针匹配+基因组重注释.R
        📄 4.差异表达.R
        📄 5.利用正常样本对单cox进行验证.R
        📄 5.利用TCGA数据对单cox结果验证.R
        📄 5.单因素生存内部交叉验证.R
        📄 1.数据预处理+去批次.R
        📄 3.验证批次效应：热图.R
        📄 6.多cox生存分析.R
        📄 5.单因素生存分析.R
      📁 资料
        📁 数据
        📁 程序
      📁 资料
      📁 程序
      📁 Result
      📄 TCGA_data.rar
        📁 程序
        📁 数据
        📁 数据
        📁 程序
          📄 代码.R
          📁 mutsig
          📁 GSE417
          📁 GSE898
          📁 tcga
          📄 cluster.exe.lnk
          📄 TreeView-1.1.6r4-win.zip
          📄 gsea-3.0.jar
        📁 数据
        📁 程序
        📁 Result
        📁 Picture
        📄 2-DifferentAnalysis.r
        📄 1-DataProcess.r
        📄 3-WGCNA.r
        📄 4-Survival.r
          📄 3-关键基因验证.r
          📄 1-数据预处理.r
          📄 2-关键基因筛选.r
          📁 result
          📁 rawdata
          📁 mRNA差异表达分析
          📁 TCGA原始数据
          📁 差异甲基化分析
          📁 GSE16011原始数据
          📁 CGGA原始数据
          📁 生存
          📁 关键基因验证-DLL3
          📄 3个独立集验证.R
          📄 风险标记与基因突变.R
          📄 诺模图and校正曲线.R
          📄 高低风险组与临床信息.R
          📄 数据预处理.R
          📄 gsea-3.0.jar
          📄 独立预后因素.R
          📄 Cox.R
            📄 EAC.output.txt
            📄 result.txt
            📄 mutation_type_dictionary_file.txt
            📄 exome_full192.coverage.zip
            📄 TCGA.ESCA.varscan.9dab6855-ba5e-4afb-b3a0-f034a6f82eb2.DR-10.0.somatic.maf
            📄 gene.covariates.txt
            📄 chr_files_hg19.rar
          📁 Result
          📄 rawdata.zip
            📄 GSE13898_series_matrix.txt
            📄 consensus002.png
            📄 标准化-898.txt
            📄 标准化-898_1.txt
            📄 898_exp.gct
            📄 标准化-898.atr
            📄 express-898.txt
            📄 标准化-898.cdt
            📄 898-亚型.txt
            📄 consensus014.png
            📄 标准化-898.png
            📄 898_sub.cls
            📄 consensus011.png
            📄 consensus001.png
            📄 consensus003.png
            📄 GPL4372.txt
            📄 417_去掉样本.txt
            📄 consensus015.png
            📄 GPL6102-11574.txt
            📄 consensus013.png
            📄 consensus010.png
            📄 consensus005.png
            📄 consensus006.png
            📄 consensus012.png
            📄 consensus004.png
            📄 consensus002.png
            📄 标准化-417.txt
            📄 consensus008.png
            📄 consensus014.png
            📄 consensus007.png
            📄 express-417.txt
            📄 标准化-417_1.txt
            📄 consensus009.png
            📄 GSE19417_series_matrix.txt
            📄 consensus002.png
            📄 consensus011.png
            📄 diff_exp.txt
            📄 consensus009.png
            📄 HUPER_core_exp.atr
            📄 HiSeqV2
            📄 consensus005.png
            📄 tcga_huatu_1.txt
            📄 HUPER_core_exp.txt
            📄 tcga-亚型.txt
            📄 图片1.png
            📄 tcga_huatu.txt
            📄 consensus012.png
            📄 ESCA_clinicalMatrix.txt
            📄 eca-tcga.txt
            📄 consensus004.png
            📄 go_diff.txt
            📄 WANG_core_exp.txt
            📄 WANG_core.txt
            📄 WANG_core_exp.cdt
            📄 tcga-sub.txt
            📄 diff.txt
            📄 consensus010.png
            📄 HUPER_core_exp.jtv
            📄 HUPER_BREAST_BASAL_VS_LUMINAL_UP.gmt
            📄 consensus003.png
            📄 WANG_core_exp.atr
            📄 consensus006.png
            📄 consensus007.png
            📄 HUPER_core_exp.png
            📄 consensus013.png
            📄 consensus008.png
            📄 sample.cls
            📄 HUPER_core_exp.cdt
            📄 tcga_sub.cls
            📄 gsea-tcga.gct
            📄 consensus014.png
            📄 consensus001.png
            📄 consensus015.png
            📄 WANG_core_exp.png
            📄 WANG_BARRETTS_ESOPHAGUS_AND_ESOPHAGUS_CANCER_DN.gmt
            📄 Rplot.png
            📄 silhou.png
            📄 tcga_exp.gct
            📄 HUPER_core.txt
            📄 WANG_core_exp.jtv
            📄 标准化-tcga.txt
            📄 kegg_diff.txt
            📄 goujian.gmt
          📄 methy450_module_site.txt
          📄 Exp_module_gene.txt
          📄 Methy450_module_num.txt
          📄 Methy450_DEsite_gene.txt
          📄 Methy450_limma_all.txt
          📄 Methy450_module_trait_PandCor.txt
          📄 methy450_module_gene.txt
          📄 Methy450_survival_all.txt
          📄 Venn_differentanalysis.csv
          📄 Exp_survival_all.txt
          📄 Exp_module_num.txt
          📄 Methy450_module_site_PandCor.txt
          📄 Venn_WGCNA.csv
          📄 Exp_module_gene_PandCor.txt
          📄 Exp_limma_all.txt
          📄 Methy450_survival_select.txt
          📄 EXP_DEmRNA.txt
          📄 Exp_survival_select.txt
          📄 Clinical_table.txt
          📄 Methy450_DEsite.txt
          📄 Exp_module_trait_PandCor.txt
          📄 2-limma.R
          📄 1-探针表达谱到lncRNA标准化表达谱.R
          📄 5-生存分析.R
          📄 4-LASSO-lncRNA对GSE打分.R
          📄 3-LASSO.R
            📁 gdac.broadinstitute.org_OV.Clinical_Pick_Tier1.Level_4.2016012800.0.0
            📁 独立预后因素
            📁 Cox
            📁 自噬相关特征在分层数据
            📁 临床信息
            📁 主成分分析
            📁 Firehose
            📁 自噬相关微阵列表达谱
            📁 三个独立的群组验证八基因预后标记
            📁 图片
            📁 风险标记与基因突变
            📁 诺模图开发用于预测预后风险
            📁